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西南大学科研团队绘就家蚕超级泛基因组图谱

时间:2022-10-10 17:41 来源:网络    阅读量:5291   
西南大学科研团队绘就家蚕超级泛基因组图谱

10月9日,西南大学发布最新科研成果。家蚕基因组生物学国家重点实验室团队历时4年完成了大规模家蚕种质资源(“千蚕基因组”)的基因组分析,绘制了家蚕的超级泛基因组图谱。该研究在国际上首次实现家蚕基因库数字化,打造“数字家蚕”,将对深化功能基因组研究、推动家蚕建模、开启家蚕设计育种、赋能“家蚕的转化与多种利用”产生深远影响。

家蚕是一种重要的经济昆虫,也是一种新的模式生物,但以前只有单一的参考基因组和部分重测序,不足以支持基因组变异和优秀基因的深度挖掘。家蚕基因组生物学国家重点实验室主任、国家蚕业产业技术体系首席科学家戴方银教授介绍,研究团队对1078份家蚕种质资源进行了深度测序,生成了55.57T基因组数据,组装了545个家蚕高质量基因组,注释了100个基因组,鉴定了4300多万个SNP,930万个InDel,340万个结构变异(SV),7330万个。

这个超级泛基因组包含了家蚕和家蚕最全的基因组信息,是世界上动植物领域最大的长阅读泛基因组。同时对家蚕的遗传变异、群体结构、人工选择、生态适应性、经济性状等进行了深入研究,取得了丰硕的创新成果。其研究论文于今年9月24日在线发表在国际著名期刊《自然·通讯》上。

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